历史上，柯尔克孜族人最早信仰萨满教。10世纪，柯尔克孜族人的意识中充满了崇拜自然神的宗教观念，主要是水神和草神。这与柯尔克孜族(当时叫蒯卡斯)以游牧经济为生密切相关。

由于当时生产和发展水平低，人们无法理解和抵制自然界中的自然现象(如干旱缺水、草枯萎等)。)，所以他们认为这些现象背后有超自然的力量，也就是说，神在主宰他们。因为水和草对人和牲畜如此重要，柯尔克孜族人崇拜主宰他们的神。同时，他们也崇拜其他自然现象。

柯尔克孜族最初崇拜图腾。著名的图腾是雪豹和鹿，世界著名柯尔克孜族作家艾特马托夫的小说《白船》也与母鹿有关。此外，他们相信女神“吴迈”，相信祖先和神。他们向南方祈祷，崇拜太阳，认为火星不吉利。

直到清朝，他们才皈依伊斯兰教，属于正统的逊尼派。大多数柯尔克孜族人信仰伊斯兰教。早在16世纪中期，他们就开始信仰伊斯兰教。他们信仰伊斯兰教和逊尼派伊斯兰教。礼拜堂是信徒的主要场所。大多数寺庙都建在城市里。伊斯兰教的五大支柱:“读功德”、“敬功德”、“教训功德”、“快速功德”和“走向功德”。

宗教禁忌

避免踩到盐和食物。盐和食物自古以来就被人们视为神圣的物品，所以践踏盐和食物被认为是一种大罪。此外，古代柯尔克孜族人还避免穿过象征食物珍宝的桌布，坐在由牲畜绒毛制成的羊毛绳上，以及穿过花绳(据说部落把狼当成图腾，而狼穿过花绳)等原始宗教禁忌。

避免抱怨月亮和星星。这个民族的祖先认为星星代表着人们的生活，是人们生活中的星星，而月亮是冰冷的上帝，所以向他们抱怨是一种罪过。

晚上不要睡觉，很容易被恶魔困扰。

晚上不要带白色的东西出去。因为牛奶是白色的，它是这个家庭的主要食物，所以白色被认为是财富、运气和神圣的颜色。晚上从家里拿走白色的东西相当于拿走财富和幸福。

避开黑色，认为黑色会引起恐惧和带来灾难，是邪恶、黑暗和绝望的象征。因此，除了在葬礼上穿黑色衣服外，黑色在日常生活中是被禁止的。